一、生物有机肥中大量的有益微生物能分解土壤中的有机物，修复并改善土壤。微生物菌体不仅能增加土壤的透气性，增加蓄水蓄肥能力，避免土壤板结。

二、生物有机肥利用土壤中的有机质，再次产生代谢物，其中含有大量促生长类物质。如生长素能促进果实成熟，植物成长，提高产量，使果实质量好，达到增产增收。

三、提高植物防病抗病能力，生物有机肥中的有益微生物能够抑制有害病菌繁殖，这样不仅省去除虫打药的成本，还能连续多年抑制土壤有害生物。

四、生物质有机肥中的微生物能把微量元素比如钙、镁、铜、锌等植物所需的矿物质溶解，大大增强土壤的供肥能力，直接被植物吸收利用。

五、有机肥中的微生物具有很强的生命力，能在土壤中长期存活，持续给作物提供养分，所以有机肥具有长效性的优势。

六、生物有机肥回首利用一些农业废弃物，可以减少环境污染，安全绿色健康，是一种环保型的肥料。